麻宮騎亜原作のコミックのＯＶ化第三弾。監督は前作「陽の章」に引き続き、村山靖で送る。３次元世界にいるルーチンは３日以内に帰還すること。拒否すれば地球を消滅させる……電次元評議会が下した決定はあまりにも突然だった。それに加えてコンパイラたちに送り込んできた刺客が今までで最強の相手との触れ込みに…。
省吾達の帰還から数百年が経った時代。人々はコンピューターシステムに支配された街「エデンシティ」で暮らしていた。それは、かつての人類の過ちを繰り返さない為に取られた手段だった。しかし、その支配を嫌ったレジスタンスによる反攻作戦が開始される。
そして明らかになった支配者ウォンダイの正体は、あの矢作省吾だった。地球に帰還した際、彼を7Gのオペレーターと認めなかったクリエーター達は、バーチャルではなく人間であるオリジナルイヴと彼との接触を恐れ、システムの操り人形ウォンダイと化してしまったのだった。
省吾はその支配から開放された直後、後を本作の主人公であるエイジタカナカに託して死んでしまう。それを知ったイヴは単身、A.D.A.M.へ向かう。人々を救う為……。
面积占东京都西部1/3、人口超过230万、八成以上由学生组成的学园都市，尖端科技发展迅速，超能力开发已经深入到城市的各个角落。超能力水平高达Level 5的御坂美琴（佐藤利奈 配音）如往常一样和初春饰利（丰崎爱生 配音）、白井黑子（新井里美 配音）等好友过着平凡的日子，间或热血爆发挫败各种扰乱城市的阴谋。某天，在调查一起现今卡事件时她邂逅了长点上机学园的布束砥信（叶山郁美 配音），从而得知用美琴的DNA大批量复制超能力者的“量产型能力者计划”。不安定的气氛在都市角落肆意蔓延……
本片为镰池和马（原作）、冬川基（作画）的原作《魔法禁书目录》的外传漫画第二季TV动画。
原作 XEBEC
総監督 能戸隆
監督 羽原信義
シリーズ構成 冲方丁
キャラクターデザイン 平井久司
メカニックデザイン 鷲尾直広
プロップデザイン 白井瑠子
色彩設定 関本美津子
美術監督 青木薫(美峰)（デザイン）、小濱俊裕(美峰)
撮影監督 青木隆
3D監督 井野元英二（CGIディレクター）
編集 伊藤潤一
音響監督 三間雅文
音楽 斉藤恒芳、ワルシャワフィルハーモニー管弦楽団
音楽制作 スターチャイルドレコード
プロデューサー 中西豪（EXODUSはエグゼクティブP）、須藤孝太郎、橋本龍→亀井博司、丸山博雄（エグゼクティブP）
アニメーション制作 XEBECzwei
製作 FAFNER EXODUS PROJECT、MBS
看似在过去的心理阴影及独自的别扭思考回路之下讴歌着“独自生活”的比企谷八幡，偶然地被生活指导担当教师平冢静带着加入了「侍奉部」。他和同社团所属的令人窒息的完美美少女·雪之下雪乃，以及班级上位阶级所属的时髦女子·由比滨结衣一同，从解决班上的人际关系问题到给学生会帮忙，度过着解决各种事件的每一天。
季节流转，时至春天。八幡与结衣，接受了雪乃最后的委托。在准备3月的毕业典礼过程中，还被彩羽请求协助毕业舞会…——追求真物的八幡，与3人的关系逐渐改变。究竟他的高中生活将迎来怎样的结局！？
2052年12月31日，为阻止科学家出门龙太郎毁灭世界，玄奘久造要求他的儿子玄奘三藏从编号1-99的99个机器人里选出一些机器人，三藏最后选出了五九、铜虎、丈、魅音和紫苑5个机器人。
2053年1月1日，龙太郎修改了超级计算机夏娃的程序，开始毁灭世界。久造制造的第一个初代机器人零为了保护三藏，她和龙太郎制造的机器人藤村宗一、藤村爽香一起毁掉了。机器人泰表面上是五九的对手，实际上他是在保护五九一行人。为了使超级计算机夏娃的程序恢复原来的样子并回到2052年12月31日阻止龙太郎，他们必须寻找拯救世界的49个零件。
向东！为了阿波特（机会生命体）和人类共存……
在未来的一千年之后，世界失去了平衡，高达一万米的巨大树木全部被人类视为阻碍而砍伐，整个世界变成了沙漠，在这个正在走向灭亡的世界中只剩人类和阿波特存活下来。
在命运驱使下相遇的三藏和五九。谜一般的少...
