炎聖神ガルーディアに変身する力を持つ不知火百花は、妹の千早とともに悪の組織デビルケーンと激しい戦いの日々を続けていた。そんな二人の前に毒蛇拳を使う女幹部ジャーリンが現れる。百花はガルーディアに変身して戦うが、変身可能時間を越えてしまい解除してしまい、毒蛇拳の餌食になってしまう。千早の助けで何とか逃げた二人だったが、百花が解毒をしている間に千早がジャーリンに捕らわれてしまう。百花の居場所を問うジャーリンの拷問に耐える千早を助けに行く百花だが、千早が捕らわれているために抵抗できずにジャーリンに一方的に痛めつけられてしまう。姉妹戦士は、凶悪な女幹部ジャーリンを倒すことができるのか！？
エンジェリオンブルー輝咲冬香とエンジェリオンレッド光宗夏希は、この世から光をなくし、闇の世界にしようとする魔女闇姫と戦い続けていた。だが戦士として冬香よりも後に覚醒した夏希は、戦闘能力で二人より劣り、それをコンプレックスに感じていた。ある日、一人で闇姫に戦いを挑んだ夏希は、闇姫に完全に敗北して囚われの身となり壮絶な拷問を受ける。冬香に助けられた夏希は、冬香が闇姫を倒しても素直に喜べず、闇姫が死んだときに残したプロテクターを、その強さに憧れて身に着けてしまう。それが闇姫の罠ともしらずに。プロテクターの闇の力で、ダークエンジェリオンとなった夏希は、闇姫の言葉にそそのかされ、自分の強さを証明するために冬香を倒そうと襲い掛かるのだった。
悪の秘密結社バゴーンによる連続爆破テロが発生し、至急現場に駆け付けたギンガイガーは最新戦術システムギンガネットと連携しバゴーンの怪人「エビル」を倒すが、エビルのマスクの下に隠されていたのはかつてギンガジュニアのメンバーだった安孫しげるだった…。
魔界から来る魔物から人間界を守る任務につくセラリオンは、魔物を見つけては戦いの日々を繰り広げていた。人間界を魔界にするために自分が魔界から召喚して放った魔物を倒され続けるバルドーラは、セラリオンが肉体的なダメージをエネルギーに変換していることに気づき、セラリオンのエネルギーがフルパワーになる前に、エネルギーを奪い、捕らえることに成功するのだった…。
