为治疗某些疾病做医学探索，酷杰三人组作为志愿者驾驶微型飞船潜入人体进行医学性质考察。途径过程使观众直观了解人体多个重要器官，科普人体免疫细胞运作机理。
酷杰、安娜、糊涂蔡在小机器人的帮助下一起复原这些植物残本，并整理出一套全新的电子版的《植物图文大全》。他们在地球各地寻找各种不同稀有植物、名贵植物、濒危植物等等。在飞船各种新功能的帮助下，他们在高大的望天树之间架起过“飞船桥梁”，变形过“小鸟”飞到炸弹树旁边去采风、还变过“小蜜蜂”帮助小机器人拍摄各种花的花蕾……
莉莎做为博士的助理，每当情绪检测仪亮起红光的时候，莉莎就会按响警报，酷杰三人组出发去帮助小朋友解决情绪问题，但是小朋友的疑问千奇百怪，酷杰三人组有时候也不知道怎么办，但莉莎会帮助他们，有时候是言语点拨，有时候是让电话手表点拨酷杰三人组，有时候利用造梦机，营造一个梦境，指点酷杰三人组去解决小朋友们的烦恼。
