2095年10月31日。
未观测的战略级魔法，将朝鲜半岛南端的军事都市及舰队消灭了。
自从被称作《灼热的万圣节》的那一天开始，
世界因新的战略级魔法师登场而震撼。
其中拥有「世界最强的魔法部队」STARS的北美利坚合众国（USNA）感觉到日益强烈的危机感，
为了揭露未观测的战略级魔法以及使用这一魔法的魔法师的真面目，而积极地在暗中行动。
约两个月后的12月24日。
就在整座城市因圣诞节的饰品和灯饰而变得热闹非凡之际，
达也等人为了给准备前往美国交换留学的雫饯行，而聚集在艾尼布利榭。
雫前往美国的期间是三个月。根据雫所说，和她交换来到第一高校的，
是和她同龄的女孩子。
与此同时，在USNA的STARS基地，一名少女正准备前往第一高校展开潜入调查。
她的名字是安洁莉娜·库都·希尔兹。
她身为STARS历代最年轻的总队长，
是操纵战略级魔法重金属爆散的US...
面对即将展开的崭新的高中生活，个性活泼开朗的元气少女保登心爱（佐仓绫音 配音）心中充满了憧憬与喜悦，新的城市，新的环境，会有怎样有趣的故事在这里发生呢？
一路寻找寄宿家庭的心爱不小心迷了路，误打误撞之中，她来到了一间名为“Rabbit House”的可爱咖啡馆之中，在这里，心爱结识了名叫香风智乃（水濑祈 配音）的神秘少女，这位面无表情态度相当冷淡的少女之后将成为心爱生命中十分重要的存在。原来，这间咖啡馆正是心爱正在寻找的寄宿地，在这里，她将以半工半读的形式度过她的高中三年，在此过程中，心爱渐渐发现了智乃不为人知的一面，亦开始了解这间咖啡屋的前世今生。
故事发生在志城南中学，桂木真己（花江夏树 配音）是刚刚转来这里念书的学生，从小到大和母亲过着相依为命生活的他性格有些内向，但实际上，真己是一个心思非常细腻体贴的男孩。在机缘巧合之中，真己加入了学校的软式网球部，这项运动彻底改变了真己的中学生活，给他的校园回忆留下了浓墨重彩的一笔。
个性非常认真的网球部部长新城柊真（畠中祐 配音）、性格桀骜不驯，常常语出惊人的雨野树（松冈祯丞 配音）、异常体贴，总是害怕给别人添麻烦的布津凛太郎（佐藤元 配音）、大大咧咧容易冲动的曽我翅（丰永利行 配音），和真己一起挥洒汗水的，还有这些个性迥异的部员们。
因双亲要在海外出差，所以一人留在日本的主人公以一年为期限住在了舅父的家里。之后转校到八十神高中的他得知一个深夜电视的传言在雨夜的十二时，只要看着关闭着的电视屏上自己的脸，就会浮现出另一个人的映像。主人公与同伴为了确认这一传言是否属实，不料被拉进了异空间，在那里被称为暗影的怪物袭击，与怪物接触时主角一行人的Persona能力觉醒。为了掘开深夜电视与连续杀人事件之间的关系，以及避免其他人被卷入该事件，他们组成了特别搜查队展开了战斗。
历经了千年的繁华，巍峨帝都早已从内部腐烂，拥有邪魔灵魂的统治者，正引领文明走向毁灭。为了解除村庄的困境，拥有绝赞剑术的少年塔兹米（齐藤壮马 配音）独闯帝都。此时帝都至高无上的皇帝还只是不谙世事的孩子，国家的实际操纵者大臣只手遮天，是帝都腐朽的根源。历经一波三折，塔兹米被曾经骗过自己的雷欧奈（浅川悠 配音）强行拉入一个神秘组织Night Raid。Night Raid是一支令帝都所有权贵富贾闻风丧胆的暗杀集团，他们是革命军下辖的秘密特殊部队，其最终目标是颠覆大臣的统治。在娜杰塔（水野理纱 配音）的领导下，赤瞳（雨宫天 配音）、雷欧奈等绝世高手云集其下。塔兹米的命运由此发生转折，而接二连三更大的纷争则将其引向未知的彼方……
本片根据タカヒロ（原作）、田代哲也（原画）的漫画改编。
地球历2110年。成功进入宇宙的人类，把多个资源小行星收归入囊，他们认为这样就与未来和繁荣挂钩了。
但是，在外宇宙的桥头保——木星圈，自称“泛银河统一帝国”的神秘势力乌鲁加尔袭来，使得地球陷入了关乎存亡的危机。
这时候，通过操控遗传基因而适应宇宙的人类诞生了，因此成立了特务机关MJP，而其下属Rabbids小队的少年们，驾驶最新锐的战斗机甲ASH，作为全地球防卫军GDF撤退的盾牌而被送往战斗前线。
面对着拥有压倒性战力的敌军，他们能够生存下去么……
