数百年前，天庭部将帝释天（若本规夫 配音）谋反杀害天帝，篡得大权。在此之后，他杀掉与之为敌的修罗王，并诛杀阿修罗一族。夜叉王（速水奖 配音）、龙王（山口胜平 配音）、迦楼罗王带着修罗一族唯一的子嗣阿修罗（伊仓一寿 配音）一路躲避天军的追赶，这一日终于来到善见城的脚下。根据九瞿的预言，最后一个斗星正在善见城中。方值此时，正是帝释天一年一度开放城池的日子，百姓歌舞升平，快乐非凡。夜叉王等人乔装打扮准备混入城中，而帝释天也谋划利用这个机会彻底铲除阿修罗一伙。宿命的对决即将展开，善见城迎来紧张而漫长的一夜……
本片根据CLAMP的同名原著漫画改编，系该动画的OVA版。
晴朗时节，江户川柯南（高山南 配音）和毛利小五郎（小山力也 配音）、小兰（山崎和佳奈 配音）以及少年侦探团的伙伴们一同来到京都，他们即将登上自卫队的宙斯盾战舰，体验一把出海作战的感觉，期间还结识了美丽又有着几分神秘的女自卫队员藤井七海（柴咲幸 配音）。谁知快乐的氛围很快被恐慌所替代，战舰上突然发现一条断掉的手臂，消失的自卫队员又引起军方的恐慌与猜测。原来某国神秘间谍X已悄悄登上宙斯盾，伺机盗取战舰上的绝密情报。
为了找出隐藏的对手，柯南和灰原哀（林原惠美 配音）、阿笠博士（绪方贤一 配音）、服部平次（堀川亮 配音）以及远山和叶（宫村优子 配音）通力合作，与间谍展开连番斗智斗勇的较量……
『めぞん一刻完結篇』のタイトルで1988年に映画化。作画、キャラクターデザインが意図的に劇画調のタッチとなっている。「完結篇」と銘打ってはいるが、テレビアニメ版で五代と八神の関係の決着がはっきり描かれなかったこと以外は完全な結末を迎えているため、実際には原作やアニメで触れられなかった、五代と八神の関係がどう決着したかにスポットを当てた番外編、外伝的な作品に仕上がっている。同時上映である『うる星やつら完結篇』の方が話題性が高く、本作はむしろおまけ的な役割であった。
あらすじ
一刻館の管理人響子といよいよ結婚することになった五代。2人を見守り続けた一刻館の住人たちは、結婚式を翌日にひかえた夜、祝福の大宴会を開こうと計画する。一刻館の常で、酒が回るにつれて大狂乱になっていく宴会。そんな中、響子は誰かからの手紙を待っているらしい。五代は不審がり、不安になる...
寧靜的小島，水清沙幼，生活純樸，海洋生物學家和他的兒子獨居島上，過著與世無爭的生活。
一日，兒子在海邊發現一頭垂死的小生物，像海獅，又像沒有殼的海龜，到底是甚麼生物的小孩子？原來，是罕有生物－－海龍。
父子兩人對著這出生不足二十四小時的小動物不知所措，為保這小生命的安全，兩人努力照顧牠，並把牠命為「Coo」。
Coo一天一天長大，世界一天一天在轉，在遠方一個政治陰謀，帶動了這小小島嶼的命運。黑暗的煙霧一天一天逼近，生活在快樂中的父子和小海龍矇然不知。
一個祥和的下午，旅行攝影機嘉茜來到小島，帶來了一個重要的消息......
日本文壇最高榮譽直木獎1988年得主景山民夫得獎之作。
一天毛利小五郎收到一张请帖，里面是谜样男子的委托，需要前往横滨的一个游乐场。小五郎和柯南一行人快乐地到达欢乐的游乐场，还带上了可以出入无阻代表VIP的手表，不料正中那名神秘男子的圈套。所有带上手表的人不得离开游乐场，否则便会发生爆炸。从现在开始到晚上十点，柯南和小五郎如果不能解开谜题，兰和少年侦探团也会随着游乐园粉身碎骨。然而更意想不到的是，那名男子居然直接称呼柯南为工藤新一。
新宿的夜晚，城市的灯火的人群中，当麻匆匆地奔跑着。“为什么？为什么又发生这种事呢？难道又要我做什么吗？”当麻疲惫地靠在拥挤的电梯中，无法忘怀的往事，一幕幕一呈现在他心头。一本流传于江户年间、内容却是他们五人的经历的剧本，使他们无法再以过去的理念安慰自己。过去的，并不能真正过去；该来的，终于来到他们面前。
一个数百年无法解脱于怨念的凄怨灵魂——铃系，一本神秘可怕的小册子，拉开了《message》阴郁的序幕。拨开历史的烟尘，揭开心底已有所愈合的伤疤，重新思考过去中真实的自己；已经了解的结局，得和的未来，被击碎的自信，彷徨的心，在深邃而冥思的心灵独白中，看到了历史长河中的人类，求索着人类心灵的意义。他们将以最大的勇气，超越悲伤，直面这“来临的真实”。
世间人多如天上之星，邂逅亦多如天上之星，紧接着的……是离别
刺耳的警报声骤然响起，通过无线电传入每个人的耳中。八号殖民地“白雪公主”正遭到突如其来的袭击，防御力量正被迅速瓦解。与此同时，“白雪公主”内部突然出现几个头带斗笠象僧侣一样的人开始追杀研究员……当入侵的机器人突入“白雪公主”的时候，里面已经血流成河。那些僧侣们留下一句“你来迟了一步，复仇者，你还未够道行啊”，就神秘的消失了。
接到求救的联合宇宙军战舰迅速赶到，但是“白雪公主”各处已经开始发生爆炸。入侵的机器人留下的唯一踪迹是玻色子跳跃前的模糊影响，而这种跳跃应该是比它大几十倍的大型战舰才能做到了，幽灵机器人的说法因此不径而走。
因为四个殖民地连续发生爆炸，地球统合军成立意外调查委员会负责调查次事，但他们不信有关机器人玻色子跳跃的事情，还把宇宙军排除在外。为此联合宇宙军自行展...
总集篇剧情有改动承接明年2月复活新作
世界最大的国家·神圣布里塔尼亚帝国终于与黑之骑士团展开冲突。这正是鲁路修=面具男ZERO的计策。但唯一超出计算之事，令鲁路修感到困惑。那就是妹妹娜娜莉。另一方面，第2皇子修奈泽尔与黑之骑士团接触。他向扇和藤堂等人揭露了动摇他们统治的ZERO的秘密。战乱进一步激化，吞噬着 众人的愤怒与悲伤、执着与愿望。为了未来，现在应该去做什么？这就是零之镇魂曲。埋葬涂满憎恨的旧时代，开拓新时代的祈祷。鲁路修与朱雀的故事，迎来冲击的明日。
