時は戦国、武田勢の冷酷無残な仕打ちに愛想をつかした若き忍者越智吉丹は、一国一城の主の夢を抱き、諸国をさまよったが、この吉丹を、武田随一の忍者の雀の三郎左がつけ狙っていた。三郎左とは別に吉丹を狙っていた銅子播磨と吉丹は、ふとめぐりあった山猿のような田舎武士にすすめられ、馬借隊の群に身をかくすこととなった。馬借隊とは、有吉宗介を隊長に、お磯ことさぎりが指揮し、米や塩をはこぶことを職業としていた。この馬借隊に当時の最新式武器“種ケ島"の運搬をたのみに来たのが例の田舎武士、実は織田家の家臣木下藤吉郎だった。藤吉郎のたくみな弁説に有吉の一党はこの運搬をひきうけた。また藤吉郎は村上水軍の参謀百蔵と滝姫を口説きおとしてこれまた運搬をやくそくさせた。種ケ島が運び込まれた日、村上水軍の船に武田の忍者が襲いかかったが、荷の中味は石コロだった。一方、有吉の一党も荷をつんで...
那是昭和二十年的盛夏。在一望无际的太平洋海面上，两个鱼雷夹着一个空空的汽油筒在飘浮。油筒里坐的是一个憨厚老实的学生兵，绰号是“那家伙”。原来广岛发生原子弹爆炸事件后，“那家伙”就成了一名特攻队员。而特攻队员的任务就是带着两颗鱼雷去撞击敌方的军舰。在执行任务之前，上级给了他们一天的外出时间。“那家伙”走出了营门，并有意无意地闯进了女人窝。他与一个小姑娘彼此产生了好感，二人在一个防空洞里产生了肉体关系。就在这天晚上，小姑娘被敌方的空袭炸死，“那家伙”也奉命带着两颗鱼雷来到了太平洋上。这个时候日本已经宣布投降，“那家伙”却一点都不知道，还在一门心思想着执行任务，结果错把一艘尿处理船当成了敌方的航空母舰并发射了鱼雷。当他被尿处理船救起以后，才知道战争已经结束了。
幕末时期，时局动荡，暗流涌动。甲州武士机龙之助（仲代達矢 饰）剑术绝伦，却拥有一颗邪恶阴暗之心。在一次剑术比赛前夕，对手宇津木文之丞（中谷一郎 饰）的妻子阿滨（新珠三千代 饰）恳求他败给丈夫，甚至不惜委身于他。然而在次日的对决中，龙之助仍然以绝对优势杀死文之丞。在此之后 ，他和被休的阿滨离开甲州，浪迹江湖。两年后，他以杀手身份加入新选组，替幕府斩杀反抗义士。在此期间，文之丞弟弟兵马（加山雄三 饰）也来至江户，并拜入剑豪岛田虎之助（三船敏郎 饰）的门下，等待为兄长报仇的良机。宿命的相逢无可避免……
本片根据中里介山同名原著中“甲源一刀流の巻 - 03 壬生と島原の巻”部分改编。该小说在报纸上连载23年，被称作“世界上最长的历史小说”。
幕府时代，公仪介错人（为剖腹者斩首的刽子手）拜一刀（若山富三郎 饰）执行上层命令，为年幼的地方领主斩首。归来后梦见妻女被人所杀，心生不祥预感。柳生手下拜访拜一刀，看见堂中为断头者摆放的灵位，遂以谋反罪名密告柳生家族。
得悉阴谋的拜一刀手斩来使，带着独子大五郎（富川晶宏 饰）杀出重围。从此浪迹江湖，以赏金杀手为生，人称“带子雄狼”。
这一日，拜一刀接到新的任务，小山田藩杉户家老谋划暗杀领主子嗣，得知消息的家老市毛请求拜一刀破坏刺杀计划。拜一刀和大五郎来至峡谷温泉场，等待猎物出现……
